Chlamydia trachomatis bakterija je koja inficira oči i spolne organe. Obično uzrokuje trahom, konjunktivitis ili spolno prenosivu bolest. “Nespecifični” uretritis i cervicitis mogu biti relativno asimptomatski i dovesti do širenja infekcije i konačno oštećenja tubula i neplodnosti kod žena ili epididimitisa i prostatitisa kod muškaraca. Moguć je prijenos infekcije s majke na dijete, a najčešći simptomi u djece su postnatalni konjunktivitis otporan na liječenje srebrovim nitratom i teška upala pluća. 

Dijagnostika infekcije može se postaviti na temelju PCR-a koji je osjetljiv, specifičan i ne zahtijeva invazivne postupke budući da je uzorak urin ili bris. Bakterijska kultura traje mnogo duže i zahtijeva bris uretre, vrata maternice ili konjunktive i savršene uvjete transporta. 

Što se tiče serološkog testiranja, serokonverzija i prisutnost IgM dokazani su u slučajevima nedavne primarne infekcije i inficirane novorođenčadi. Prisutnost IgG ukazuje na kontakt s bakterijom, koji se ne može datirati, jer ta antitijela postoje dugo vremena i na njih utječe samo djelotvorno liječenje u kasnoj fazi. Prisutnost specifičnog IgA može biti od interesa u slučajevima aktivne infekcije. Zbog nedovoljne specifičnosti testa, moguće su serološke križne reakcije između različitih vrsta Chlamydia.